生化農藥是近年來非常流行的農藥，它需要滿足以下兩個要求。一是對防治對象無直接毒性，僅有調節生長、幹擾交配或引誘等特殊功效；另一種是天然化合物，如果是人工合成的，其結構應與天然化合物相同（允許異構體比例有差異）。主要包括以下幾類：化學費洛蒙、天然植物生長調節劑、天然昆蟲生長調節劑、天然植物抗性劑等。

微生物農藥是指以細菌、真菌、病毒、原生動物或基因改造微生物等活體生物體為活性成分的農藥。如芽孢桿菌屬、鏈黴菌屬、假單胞菌屬等。

植物源農藥是指活性成分直接來自植物的農藥。如苦參鹼、苦楝素、魚藤酮、蛇床子素等。

農用抗生素是指微生物生命活動過程中產生的、能在較低濃度下對植物病原菌表現出特定藥理作用（主要指抑製或殺滅病原菌的作用）的天然有機物質。如阿維菌素、春雷黴素、多殺菌素、伊維菌素、井岡黴素等。

但需要指出的是，農用抗生素是透過微生物發酵而生產的。雖然同為生物農藥，但從登記資料要求來看，除部分檢測項目因產品特殊性質無法提供（可申請減免）外，其他與化學農藥基本相當。目前，世界上幾乎沒有其他國家將其視為生物農藥，但從來源、研究和應用狀況來看，抗生素農藥在我國歷史上和現在仍然是生物農藥中非常重要的一類。